site stats

Chip-atlas数据库

WebKidney Renal Clear Cell Carcinoma (TCGA, PanCancer Atlas) 512 samples. Renal Clear Cell Carcinoma (UTokyo, Nat Genet 2013) 106 samples. Renal Non-Clear Cell Carcinoma Select All; Kidney Chromophobe (TCGA, Cancer Cell 2014) 66 samples. Kidney Chromophobe (TCGA, Firehose Legacy) 113 samples. WebOct 4, 2024 · ChIP-Atlas. An integrative, comprehensive database to explore public Epigenetic dataset, including ChIP-Seq, DNase-Seq, ATAC-Seq, and Bisulfite-Seq data: ChIP-Atlas covers almost all public data …

推荐一个实用的转录调控数据库,帮你找转录因子结合 …

http://www.ciidbnu.org/chip/chips.asp?year=2013 http://chip-atlas.org/ ark primal game data_bp fix https://glynnisbaby.com

ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of

Web如果有更多人需要chip数据,请直接在chip项目有关平台申请。 (3)本数据使用制度的最终解释权归属于“北京师范大学中国收入分配研究院”。 (4)如果您使用CHIP数据有一些研究成果,希望您能告诉我们,以便于我们整理CHIP数据的使用情况。 WebChIP-Atlas是一个用于可视化和利用ChIP-seq公共数据的综合和全面的 数据库 。. 研究人员充分整合了6个代表性模式生物 (人、小鼠、大鼠、果蝇、线虫和芽殖酵母)的公共 ChIP … WebAug 21, 2024 · ChIP‐Atlas数据库网页工具-(2024年6月份)第21周(总第69周 ). 本次分享的文献发表了一个网页数据库,把其它数据库(GEO, ArrayExpress, DDBJ, ENCODE等等)的表观数据(主要是ChIP-seq and DNase-seq)整合,主要是6个模式生物的数据,包括 (human, mouse, rat, fruit fly, nematode, and ... ballonfahrt kempten

TIMER2.0 - Cistrome

Category:表观 Enhancer ChIP-seq 转录因子 数据库专题 - 博客园

Tags:Chip-atlas数据库

Chip-atlas数据库

ChIPBase v3.0: The Encyclopedia of Transcriptional Regulations of …

Web选择完之后,igv内就会倒入这个TF的chip-seq的数据,如下图。 你可以在igv中找到自己的gene of interest,然后看看这个峰的位置在哪。 以上就是教你如何利用现有的public Chip-seq数据来搜索调控你gene的TF。 http://www.ciidbnu.org/chip/

Chip-atlas数据库

Did you know?

http://timer.cistrome.org/ WebThe most complete collection of uniformly processed ChIP-seq data on identification of transcription factor binding sites for human and mouse. Convenient web interface with …

http://www.ciidbnu.org/chip/ http://gtrd20-06.biouml.org/

WebNov 23, 2024 · ChIP-Atlas收集整理了SRA数据库中的大量chip_seq数据,并基于这些原始数据进行了后续分析,将分析结果整理成在线服务并发布,方便检索与查询/ 构建的流程 …

WebMar 28, 2024 · 为了弥补这个不足,研究人员开发了基因转录调控数据库:GTRD。. GTRD从SRA、GEO、ENCODE等公共数据库中收集转录因子相关的ChIP-seq数据,采用标准流程进行peak calling分析,并基于已有的 …

WebChIP-Atlas is able to show alignment and peak-call results for all public ChIP-seq and DNase-seq data archived in the NCBI Sequence Read Archive (SRA), which … ark primal tek gigaWebThe functional genomics data collection (ArrayExpress), stores data from high-throughput functional genomics experiments, and provides data for reuse to the research community. In line with community guidelines, a study typically contains metadata such as detailed sample annotations, protocols, processed data and raw data. Raw sequence reads ... ballonfahrt in kappadokienWebGene Expression Omnibus. GEO is a public functional genomics data repository supporting MIAME-compliant data submissions. Array- and sequence-based data are accepted. … ark pruebahttp://www.bio-info-trainee.com/4538.html ark pteranodonWeb对于TCGA (The Cancer Genome Atlas)这个在生信研究中大佬级别的存在,想必大家伙儿都已经耳熟能详了吧?. 前不久我们一本八道老师对TCGA家族的好兄弟TCIA (The Cancer Immunome Atlas)做了详细介绍,大快朵颐之后,不少小伙伴不禁感慨意犹未尽。. 那么在今天,就来说说TCGA ... ballonfahrt lahntalWebchip项目组按照东、中、西分层,根据系统抽样方法抽取得到chip样本。 样本覆盖了从15个省份126城市234个县区抽选出的18948个住户样本和64777个个体样本,其中包括7175户城镇住户样本、11013户农村住户样本和760户外来务工住户样本。 ar kpp pratamaWebApr 18, 2024 · 芯片图集 是一个数据库,它收集根据ChIP-Seq和DNase-Seq数据计算出的床文件,这些数据已存储在Sequence Read Archive(SRA)中。该数据库具有Web界面,可从计算出的峰调用数据 … ark ps4 dino pen